PTMScan® 发现在转化研究中的应用（一项案例研究）
从实验室到临床
CST 针对非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的酪氨酸激酶活性开展了一项整体研究，旨在发现新的致病因素 (1)。磷酸化酪氨酸抗体用于在 LC-MS/MS 分析前，对 41 种 NSCLC 细胞系和 150 种 NSCLC 肿瘤中的磷酸化肽进行富集。该分析在 2700 多个蛋白质上识别出 4551 个磷酸化酪氨酸残基。酪氨酸激酶ALK（间变性淋巴瘤激酶）是前十种有待后续分析的候选产物之一。
进一步的研究发现，在某些 NSCLC 细胞系和肿瘤中 EML4（棘皮动物微管相关蛋白样 4）的 N 末端会与 ALK 的 C 末端发生融合。3%-7% 的 NSCLC 患者的肿瘤中存在高度易致癌的融合蛋白 (1-4)。表达 EML4-ALK 融合蛋白的癌细胞对于小分子 ALK 抑制物克唑替尼敏感，而且 2011 年 FDA 已经批准将克唑替尼用于对 ALK 阳性 NSCLC 的治疗 (2)。
CST 开发出一种高特异性和敏感性的抗体 ALK (D5F3®) XP® Rabbit mAb #3633，它可以检测全长 ALK 和 EML4-ALK 融合蛋白。FDA 已批准了免疫组织化学 (IHC) 伴随诊断检测，此项检测采用了 CST 授权的 ALK D5F3 克隆 (3)。这将帮助医生确定哪些 NSCLC 患者可以采用 Crizotinib 进行有效治疗。
使用 ALK (D5F3®) XP® Rabbit mAb #3633，对具有高水平（上图）与低水平的（下图）ALK 表达的石蜡包埋的人肺癌组织进行 IHC 分析。
参考文献
- Rikova K, Guo A, Zeng Q, Possemato A, Yu J, Haack H, Nardone J, Lee K, Reeves C, Li Y, Hu Y, Tan Z, Stokes M, Sullivan L, Mitchell J, Wetzel R, Macneill J, Ren JM, Yuan J, Bakalarski CE, Villen J, Kornhauser JM, Smith B, Li D, Zhou X, Gygi SP, Gu TL, Polakiewicz RD, Rush J, Comb MJ (2007) Global survey of phosphotyrosine signaling identifies oncogenic kinases in lung cancer. Cell 131(6), 1190–203.
- FDA approves Xalkori with companion diagnostic for a type of late-stage lung cancer
- Ventana receives FDA approval for the first fully automated IHC companion diagnostic to identify lung cancer patients eligible for XALKORI® (crizotinib)